Dal secondo binario della vecchia stazione di Novara Nord, dismessa nel 2005, si staccava un breve raccordo, interrotto da un cancello, che raggiungeva gli impianti delle Ferrovie dello Stato, permettendo lo scambio di materiale rotabile con la rete statale. La nuova stazione, che ha sostituito la precedente, è stata ricavata a lato di uno dei due binari che collegano lo scalo merci della stazione RFI di Novara alle altre linee della rete. Essendo questi binari raccordati a triangolo, la parte terminale della stazione è ancora in curva come la vecchia.